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逆合成科学场景详细规范

English

本目录把逆合成相关能力拆成六个可独立运行、独立产生结果、独立评分的科学场景。它们不是一条强制流水线:狭义逆合成规划由场景 1 和场景 2 构成;场景 3–6 分别评价反应理解、正向验证和实验执行属性。

文件

文件 科学问题
01_single_step_retrosynthesis.md 固定 USPTO-50K 测试集上的目标产物到前体集合预测。
02_multistep_route_planning.md 固定 PaRoutes 目标、库存和搜索预算下的多步路线搜索。
03_atom_mapping.md 完整反应的原子对应和变化键识别。
04_forward_prediction.md 固定专利测试集上的反应物/试剂到产物预测。
05_condition_recommendation.md 固定反应两侧下的 Top-K 类别型条件推荐。
06_yield_estimation.md Buchwald–Hartwig 分布外划分上的收率回归与不确定性。
README.md 英文目录说明。

Query、GT 与生成 codebase

目录 范围
queries/ 六份冻结的 OpenAI4S prompt,逐项说明公开输入文件协议。
gt_codebases/ 六个经过仓库审查的 GT 参考入口。
openai4s_codebases/ 由 OpenAI4S CLI 实际运行产生的同名实现及生成 provenance。
pipelines/ GT 入口的废弃兼容别名。
test_cases/ 评测 fixture、数据库注册表、一键安装器和私有 evaluator 入口。

Pipeline 进程只读取安装后的 public/ 文件。只有 pipeline 完成并冻结输出后, evaluator 才读取 private_evaluator/。 GT 代码不得标成 OpenAI4S 生成结果;缺少 API key 或生成失败时,生成 manifest 必须 如实记录阻塞状态,不得复制参考实现来填充。

上级 ../SCENARIO_zh.md 保留为六问题总览和依赖图;本目录文件是 Benchmark 设计的详细草案。每个场景只有在数据快照、划分、许可证、文件校验和以及私有 evaluator 边界全部冻结后,才能从“设计完成”升级为“可发布 Benchmark”。模型输出、论文报告数字或另一个模型的预测不得充当 Ground Truth。